Ο Αθηναϊκός δημιουργήθηκε από ποδοσφαιριστές της ιστορικής τότε ποδοσφαιρικής ομάδας Π.Σ. Γουδί. Όταν το 1914 παίκτες από το Γουδί αποχώρησαν, ίδρυσαν την ομάδα «Χόουπ» (Ελπίδα). Το 1917 που έγινε επίσημο σωματείο από το Πρωτοδικείο Αθηνών, έλαβε το όνομα ''ΑΘΗΝΑΙΚΟΣ''. Ως Ιδρυτικά μέλη αναφέρονται οι Ψύχας , Γόνας , Χρυσάφης , Πατούσας , Ρόγης , Σαρρής και άλλοι. Ο Αθηναϊκός συμμετείχε το 1931 στην Α' κατηγορία, αλλά επειδή έδωσε φιλικό παιχνίδι με τη μη αναγνωρισμένη ομάδα ''Πράσινα Πουλιά'', την οποία είχαν στελεχώσει δυσαρεστημένοι παίκτες του Παναθηναϊκού, τιμωρήθηκε με τον υποβιβασμό στη Γ΄ κατηγορία. Ανέβηκε ξανά στην Α' κατηγορία το 1940-1941 και έως την 28η Οκτωβρίου 1940, οπότε και ξέσπασε ο πόλεμος, ήταν πρωτοπόρος. Διακόπηκε ωστόσο το πρωτάθλημα. Ο Αθηναϊκός τερμάτισε ως επικεφαλής και στο ανεπίσημο πρωτάθλημα Αθηνών-Πειραιώς, που διεξήχθη στα χρόνια της κατοχής, τη σεζόν 1943-44. Μέχρι και τον Β' Παγκόσμιο Πόλεμο, ο Αθηναϊκός ήταν από τα πιο πλούσια σωματεία. Τα πολυτελή του γραφεία, όμως, πυρπολήθηκαν στα γεγονότα του Δεκεμβρίου 1944 (Δεκεμβριανά), με αποτέλεσμα να καταστραφούν τα αρχεία και τα τρόπαια του συλλόγου και να μείνει άστεγος. Από το 1950 μετείχε στην Α2 κατηγορία της ΕΠΣ Αθηνών, ενώ τον Ιούλιο του 1952 συγχωνεύτηκε με την Α.Ε. Νέας Ελβετίας και προέκυψε η νέα ονομασία Αθηναϊκός Νέας Ελβετίας Αθλητικός Σύλλογος.
